Proposant un nouveau regard sur l'origine des personnages légendaires créés par J.M. Barrie, le film s'attache à l'histoire d'un orphelin enlevé au Pays Imaginaire. Orphelin, Peter est un petit garçon espiègle et turbulent, qui refuse de grandir. Un jour, il est envoyé par magie au Pays imaginaire, peuplé de pirates et de fées. Cette terre de contes est sous la coupe du tyrannique Barbe-Noire. Peter finit par tomber dans les griffes du redoutable flibustier. Celui-ci lui raconte une prophétie : un petit garçon qui sait voler viendra le détrôner. Or Peter semble être l'élu car il se découvre ce don. Lily la Tigresse vient à sa rescousse car elle est persuadée qu'il est le seul à pouvoir libérer le Pays imaginaire. Avec l'aide du capitaine Crochet et de toutes les créatures féeriques, Peter se lance dans la bataille contre Barbe-Noire...