Les quatre Beatles partent dans un voyage organisé, le Magical Mystery Tour, à travers la campagne anglaise. Un grand nombre d'aventures insolites vont arriver aux protagonistes.
Il s'agit plus de la trame d'un film à sketchs que d'une histoire à proprement parler.
Seul Ringo et sa tante, les organisateurs, ainsi qu'un vieillard se prenant pour le guide sont utilisés pour faire passer le spectateur d'une histoire (sketch) à une autre.